MBR膜片在线清洗的缺点，MBR膜片“在线化学清洗”不能彻底替代“外浸渍化学清洗”，而只能是延伸“外浸渍化学清洗”的周期，减小“外浸渍化学清洗”次数。如用户要完成真实意义上的“在线化学清洗”只能选用“ MBR膜长时刻安稳运转的首要控制条件。
　　坚持膜生物反应器内杰出的水力循环条件。为坚持MBR膜面杰出的水力冲刷效果，反应器升降流通道的规划要合理，曝气量要恰当。做好膜-生物反应器的发动运转作业。应提早接种污泥的浓度，待膜生物反应器运转根本安稳后再开端膜分离的运转。留意膜的日常保护。可采纳在线上下对流式空曝气、在线反冲式药洗等一些简略的手法来减缓膜过滤阻力的增长速度，延伸膜运转时刻。当膜污染极为严峻，常常保护效果不大时，可将MBR膜组件放至按必定浓度与办法制造好的药剂浸泡必定时刻，以康复膜的过滤功能。坚持操作条件的安稳。操作条件的常常改变会促进MBR膜组件的阻塞进程，加快膜污染。MBR膜组件污染的首要解决办法,在线上下对流式空曝气（是指按必定的周期中止进出水，加大曝气强度使用特别的膜机架水流条件接连进行曝气二至三小时，以冲脱沉积在膜表面上污泥层的办法。此法较简略无需配套设备，运转中有必要选用）。